Первый директор музея Д. Арсенишвили и первый научный сотрудник Н. Демина.
После реставрации 1998 года значительно расширилась экспозиция – новые выставочные пространства открылись в церкви архангела Михаила XVII века и трапезной палате XVI века. Память о первом директоре музея Давиде Арсенишвили и исследовательнице Наталье Деминой была увековечена памятными досками работы Зураба Церетели и Владимира Суровцева, открытыми в 2001 году на территории музея.