Начальник ПГУ имел 1–2 первых заместителей и нескольких обычных заместителей. К середине 60-х гг была введена географическая специализация (заместитель по Западному полушарию, курирующий 1-й и 5-й отделы, по Европе и по Азии)[89]. Впоследствии число региональных заместителей росло — так, уже к концу 60-х гг. вместо одного заместителя по Азии были введены должности по Ближнему и Среднему Востоку и Африке и по Дальнему Востоку. Также заместителем начальника по должности постоянно являлся начальник Управления «С» (нелегальная разведка), с начала 60-х — начальник отдела кадров, с 1974 г. — начальник Управления «Т» (нелегальная разведка). Кроме того в разные периоды, у начальника ПГУ были один или несколько заместителей по общим вопросам. Наиболее высокопоставленные офицеры действующего резерва ПГУ, работавшие под прикрытием в ведомствах, также могли иметь ранг заместителя начальника[90].
1-е заместители начальника:
Заместители начальника:
Заместители начальника — начальники Управления «С» (нелегальная разведка):
Заместители начальника — начальники Управления «Т» (научно-техническая разведка):
Заместители начальника по кадрам — начальники отдела кадров:
Заместители начальника в действующем резерве:
Партийное руководство разведкой осуществляли партком КПСС и комитет ВЛКСМ. Секретарями парткома являлись
Для координации работы всех служб по главному противнику к 1981 году была создана группа «Север», под руководством 1-го заместителя начальника, курирующего США. В ее состав входили начальники Управлений «С», «Р», Службы № 1 — Управления «РИ» и 1-го отдела[91].
Первоначально структура ПГУ повторяла структуру 2-го Главного управления МВД (см. выше), временно исполняли обязанности те же начальники отделов. В июле 1954 года была проведена реорганизация:
Секретариат
Управление «С» (нелегальная разведка)
1-й отдел (США, Канада, Латинская Америка)
2-й отдел (Англия и страны Скандинавии)
3-й отдел (ФРГ, Австрия)
4-й отдел (Западная Европа)
5-й отдел (Южная Европа)
6-й отдел (Восток)
9-й отдел (эмиграция)
10-й отдел (научно-техническая разведка)
Руководящий состав ПГУ, 50-летие внешней разведки, 1970 г. Центральный клуб им. Ф. Э. Дзержинского. Сидят (слева направо): Ефимов А. И., Ф. В. Мачульский, В. Г. Павлов, В. И. Старцев, Ф. К. Мортин, А. М. Сахаровский, Б. А. Соломатин, С. А. Кондрашев, М. Г. Котов.2-й ряд: М. И. Лопатин (2-й слева), В. П. Бурдин (3-й), Н. П. Гусев (5-й), А. С. Воскобой (8-й), Н. М. Галушин (11-й).3-й ряд: А. И. Лазарев (1-й слева), Г. А. Орлов (7-й), В. К. Бояров (12-й), Д. А. Ерохин (16-й), Ю. И. Дроздов (17-й).4-й ряд: О. Д. Калугин (3-й), Е. И. Шишкин (6-й), Д. И. Якушкин (9-й), В. Г. Красовский (10-й)
11-й отдел (связи с органами безопасности соцстран)
13-й отдел (террор и диверсии)
14-й отдел (внешняя контрразведка)
15-й отдел (использование министерств и ведомств СССР в разведывательных целях)
16-й отдел (информации и переводов)
Отдел радиосвязи
Отдел оперативного учета и архив
Финансовый отдел
Отдел кадров
Впоследствии происходили следующие изменения:
В апреле 1955 г. был создан отдел оперативной техники;
В феврале 1958 г.6-й отдел был разделен на 7-й (дальневосточный) и 8-й (ближневосточный) отделы, 5-й отдел был расформирован с передачей функций в 4-й.
В январе 1959 г. на базе службы дезинформации КИ при МИД СССР был создан отдел «Д» (дезинформация).
В 1960 г.3-й и 2-й отделы поменялись номерами, на базе африканского направления 8-го отдела создан 6-й отдел,
В сентябре 1962 г.16-й отдел был преобразован в Службу № 1;
В 1963 г.9-й и 14-й отделы были объединены в Службу № 2 (внешняя контрразведка), 10-й отдел был преобразован в Управление «Т». Освободившийся 14-й номер после этого получил отдел оперативной техники.
В 1964 г. на базе направлений 7-го отдела, занимавшихся Китаем, КНДР и Северным Вьетнамом (ДРВ) был создан новый 6-й отдел (социалистические страны Азии), прежний 6-й отдел был разделен на 9-й (англоязычные страны Африки) и 10-й (франкоязычные страны Африки) отделы.
В 1966 г.13-й отдел преобразован в отдел «В», отдел «Д» — в Службу «А» (активные мероприятия), 15-й отдел сменил номер на 12-й. Освободившийся 13-й номер после этого получил отдел радиосвязи, 15-й — учетно-архивный отдел.
15 ноября 1966 г.11-й отдел выведен из состава ПГУ и преобразован в самостоятельный отдел КГБ с тем же номером;
24 июля 1968 г.11-й отдел КГБ вернулся в состав ПГУ;
14 октября 1968 г. Школа № 101 преобразована в Институт КГБ (с декабря — Краснознаменный институт)
В конце 1968 г. был создан 16-й отдел (разведывательные операции по иностранным шифровальным службам).
В 1969 г. была созданы Служба «И» (компьютерная), 5-й отдел (латиноамериканский) сменил номер на 2-й, 2-й отдел (германо-австрийский) на 4-й и 4-й отдел (западноевропейский) — на 5-й.
В 1970 г.13-й отдел был преобразован в Службу «Р».
В 1974 г. Служба № 2 была преобразована в Управление «К», Камбоджа и Лаос были переданы из ведения 7-го отдела в 6-й, на базе направлений 7-го отдела, занимавшихся странами Южной Азии (Индия, Пакистан, Бангладеш, Непал, Шри-Ланка, Бирма) был создан новый 17-й отдел, а на базе направлений 8-го отдела по арабским странам — 18-й отдел.
В 1975 г. были созданы Управление «Р» (оперативное планирование и анализ) и 19-й отдел (эмиграция)
Во второй половине 70-х гг. Служба «И» была преобразована в Управление «И».
В 1977 г.14-й отдел был преобразован в Управление «ОТ», был создан 20-й отдел (связи с органами безопасности дружественных развивающихся стран).
В июле 1979 г. на базе НИИ Управления «Т» был создан НИИ разведывательных проблем (НИИРП).
В 1970-е гг. существовало Специальное эксплуатационно-техническое управление (СЭТУ).
В 1980 г.12-й отдел был преобразован в Управление «РТ».
В 1984 г. Служба № 1 преобразована в Управление «РИ». В том же году после смерти Ю. В. Андропова его имя было присвоено Краснознаменному институту.
К 1980-м гг. отдел кадров был преобразован в Управление, были созданы административный отдел, дежурная служба, отделение дипломатической почты и оперативная библиотека.
В 1990 г. был создан 12-й отдел (экономическая разведка).
Таким образом к 1991 году структура ПГУ имела вид:
Секретариат
Группа консультантов при начальнике ПГУ
Дежурная часть
Управление «И» (компьютерное)
Управление «К» (внешняя контрразведка)
Управление «ОТ» (оперативная техника)
Управление «Р» (оперативное планирование и анализ)
Управление «РИ» (информационно-аналитическое)
Управление «РТ» (разведка с территории СССР)
Управление «С» (нелегальная разведка)
Управление «Т» (научно-техническая разведка)
Служба «А» (активные мероприятия)
Служба «Р» (радиосвязь)
1-й отдел (США, Канада)
2-й отдел (Латинская Америка)